A Clínica de Pequenos Animais abrange uma área de 76m² e é destinada ao atendimento veterinário preventivo e curativo a cães, gato dentre outros animais de pequeno. Através do atendimento preventivo a Clínica também realiza controle de zoonoses e outras doenças.
Há também a sala de cirurgias que abrange uma área de 252m² onde são realizadas cirurgias que orientadas pelos supervisores e professores, de animais de pequeno porte.
A prática permite aos alunos uma interação maior entre os conteúdos aplicados em forma de teoria e a técnica, onde os alunos atuam no atendimento clínico e em cirurgias em animais de pequeno porte, com capacidade 15 alunos.